党建工作责任制作为党的制度建设的一个重要内容和党建工作的重要载体，对全面落实党要管党、从严治党方针，严格基层党组织工作责任，增强基层党组织解决自身矛盾能力，推动基层党建工作深入开展发挥了积极作用，但是在落实党建工作责任制过程中，不同程度地存在着以下几个问题：
“一是认知不够。一些基层党组织特别是部门负责人缺乏‘党要管党、从严治党’的责任意识，存在‘重业务轻党建行政’的思想，把行政事务作为‘主业’而却把党建工作作为‘副业’，没有认真履行落实党建工作责任制的职能作用。一些部门认为党建工作不是‘一票否决’考核项目，‘抓与不抓一个样’，没有认真严格执行党的组织生活制度和务实地抓好上级安排的党建工作任务。有的党组织对党建工作有‘说起来重要，做起来次要，忙起来不要’的思想，更有少数党政领导干部认为经济工作是硬指标，经济工作做好了，党建工作也好做，有‘一好遮百丑’的倾向，并没有真正重视党建工作。”
“二是考核不细。在党建工作责任制目标考核内容的设置上，任务量化指标较为笼统，导致在实际考核评价中，难以定位，考核模糊化，甚至可能出现工作做得好考核结果不理想，工作落实较差的考核结果靠前，本末倒置。在落实党建工作责任制中，对哪些情况下要追究责任，责任追究主体不够明确；在责任主体的认定上，第一责任人、直接责任人、具体责任人各自所负的职责模糊，难界定。”
“三是措施不利。部分党组织没有认真研究落实党建工作责任制的措施，工作简单，方法、点子不多，对新形势下履行党建工作职责的能力较弱，作风漂浮，不深入基层，不深入实际，没有认真分析研究新情况、新问题，不能严肃对待和认真处理基层党建工作中的热点难点问题。落实党建工作责任制的投入不足。从人力投入上看，领导班子配备改革后，党委副书记职数减少到一人，同时兼任纪委书记，还要负责群团、老年等工作，工作量成倍增加，分管副书记的精力投入不足，配备的党务干部，因人少，多数党务干部都兼任2至3项工作，精力不能集中，抓落实的力度不大，满足于一般化和过得去。从财力投入上看，很多地方党委没有单独落实党建工作责任制的工作经费和活动经费，工作推进的难度较大。在落实党建工作责任制中，涉及如党支部活动经费、党员活动场所、党组织学习考察经费、党建试点示范等项目建设，但是党建工作没有专门建设项目，基层党组织工作缺乏保障经费，涉及党组织建设的物资只有从其他渠道挤占，经常如此，导致目前一些党建基础建设项目越来越难以协调落实，同时，由于没有健全基层党组织工作经费保障机制，区镇财政预算投入在落实党建工作责任制方面不多，部门给党总支和党支部投入活动经费不够，党组织办公场所紧张，党员办公基础设施落后。”
“四是监督不严。围绕履行党建工作责任，各级党委都建立了一系列工作制度，但实际运行过程中，监督管理措施相对滞后，对制度落实不到位、职责履行不到位等问题，缺乏及时有效的监控措施和制约手段，在一定程度上影响了责任制的全面落实。有的基层党组织对落实党建工作责任制只部署不督导、重安排轻落实，不重视建立健全强化工作问责制，对工作滞后、绩效较差、软弱涣散的支部或支部内长期不过组织生活、不开展集体活动等问题没有及时深入了解情况和研究应对办法。如工作因安全生产、计划生育、社会治安等工作过失，受到责任查究和党内行政处分的领导干部屡见不鲜，但在落实党建工作责任制方面还没有人受过处分。同时，基层党建工作考核奖惩机制不完善，平时的督促检查指导工作开展不好，特别是考核结果运用得不够充分，奖惩措施落实得不够严格，还没有在综合考评中凸显出党建工作责任制的落实情况。”（金钊主编：党的建设科学化学习读本，国家行政学院出版社，2010年3月）
怎样解决上述这些问题，值得各级党务工作者认真思考。笔者认为应从以下几个方面对症下药：
1．切实提高认识，不断夯实落实党建工作责任制思想基础。要牢固树立“抓党建是本职、不抓党建是失职”思想，不断增强书记抓党建工作的责任意识；开展思想排查教育活动，不断统一党员领导干部抓党建的思想认识；建立党建工作“一票否决”制，不断增强党员领导干部抓党建意识；开展个别约谈活动，不断帮助党员领导干部校正认识、理清思路；加大宣传力度，不断营造落实党建工作责任制的良好思想舆论氛围。
2．完善考核，不断提高党建工作责任制落实情况考核水平。要明确考核价值标准，进一步增强考核评价目标激励、责任激励、效果激励导向作用；科学设置考核指标，做到程序与标准、年末考核与日常检查、统计结果与综合分析、“显绩”与“潜绩”相结合；完善考核程序，努力实现考核成绩突出、测评随意性减少、群众座谈实效增加、查看资料和听取汇报事实依据足；细化任务指标，进一步增强考核评价可操作性；强化考核体系执行纪律，增强考核评价权威性；加大考核结果运用力度，把考核结果与表彰和推荐各级各类先进结合起来，把考核结果作为领导班子及其成员工作实绩评定的重要内容，作为领导干部选拔任用、培养教育和奖励惩戒的重要依据。
3．细化得力措施，不断推动党建工作责任制深入落实。要进一步完善党委统一领导、有关职能部门各司其职、密切配合的工作体制，不断加强党建工作责任制落实工作组织领导；完善党建工作推进会制度，不断推动党建工作任务落实；完善抓党建工作情况报告和专项述职制度，不断推动抓党建工作情况报告和专项述职活动深入开展；完善财政投入制度，根据区镇实际，适时增加区镇财政预算在落实党建工作责任制方面的投入，不断保障落实党建工作责任制工作经费和活动经费；建立落实党建工作责任制工作基金制度，按照上级党组织补助一部分、党费转出一部分、党员上缴一部分的原则，筹集落实党建工作责任制工作专项资金，并将资金存入银行，设立基金账户，不断增强落实党建工作责任制工作保障能力；开展联手共建活动，让经费足的部门党委或党总支与经费不足的部门党委或党总支联手开展组织活动，努力破解党组织活动经费不足问题；开展借力助建活动，积极借用机关企事业单位党员活动场所或利用机关企事业单位集体外出学习机会组织本部门相应活动，努力解决党员活动场所不足、党组织学习考察费用不足问题。
4．强化监督，不断提高党建工作责任制落实情况监督水平。完善地方党委常委会向全委会报告制度，不断推动党建工作责任制落实情况全委会监督；完善党建工作督查制度，不断推动党建工作责任制落实情况动态监督；完善组织评议制度，不断推动党建工作责任制落实情况党组织监督；建立社会评议制度，不断推动党建工作责任制落实情况社会监督；完善党建工作责任追究制度，不断推进党建工作责任制落实情况法律监督；建立党员观察员制度，不断推动党建工作责任制落实情况党员监督；完善党代表调研制度，不断发挥党代表在党建工作责任落实过程中的监督作用；完善媒体公开制度，不断推动党建工作责任制落实情况媒体监督。
5．创新载体，不断搭建落实党建工作责任制新平台。要开展创先争优目标细化活动，为落实党建工作责任制搭建目标平台；开展落实党建工作责任制情况现场观摩评比活动，为落实党建工作责任制搭建激励平台；开展落实党建工作责任制经验交流活动，为落实党建工作责任制搭建交流平台；开展媒体采风活动，为落实党建工作责任制搭建展示平台；设立党委书记谈党建论坛，为落实党建工作责任制搭建思想平台；开展专项问题整治活动，为落实党建工作责任制搭建治理平台；开展项目党建活动，为落实党建工作责任制提供合作平台；开展党建工作责任制落实创新试点活动，为落实党建工作责任制搭建创新平台。