范文一:巢式病例对照研究
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[ 分 类p号 】1R1 【 c图 1 文献 标 识码 】 B【 章 编号 】01— 7 (306 1 0—70 8 文 46 6 20 ) 3— 0 53
O
式巢例病对 照研究 ( se eao ot td 又) Ne td C-s Cnr Sluy
R o ur die M “等 ̄ s1 用采前 性方瞻 在法坦桑尼 亚村农 地区 究研
V 2 发病V间之关系 。他的选择17们 2 在例 2H内 年[v 阳 套称式病叠对照研究例队列 内病或例照对究 ( a 研- nrC lS H一 H与ICm to o
Suy N t e hr ,是 ) 病将 例 照对 研究和 队 研列 td s i aCoo t d e
转n 病阴例 作为观测 对象 ,非 匹 方配选 法6 6 H择Ⅳ阴 性 对 3 例 ,检测照究对研象H的 一 S 体 抗,分析SH2 V 2 一V 与HⅣ 病之发
的间关 系 。
究
进组合行形后的一成种新的研 究法方即在对一, 事先个确定
好 的列队进随行观察的访基上 础,再用病应例对 研照究 (要主 是
匹 病例 对照配研究 )的计设思进行路研 究分 析。
212回顾 巢 性式 例对照病 究 研 ( ̄. . R
ev t  ̄a eN e C d
nClr d t) 这:设种计类 是型根 研究开据始 前的一之 o 段o tuy S
1设 计 理 原
式 病巢例 照对 研究 将 病是 例 对 照 研究与 队 列 研究 的 重新 组 合后 形成 的 一 种 新 的 设 计 路思 其, 设 计原 理是 首 先 ,根 据一
特定 时 的情间 况选 某择 人 一 作群为研 究 F ̄ AT 根 据, 现在 的 况情 J
定病例组确和照组 ,对在时1 司其的上牛 为从去到过在现。 这寺 种型的设类效计率高 ,能更很陕 出果结 但要求,有信完整息的 列且队队该列的生物标本学先 事已集并保收 ,存故— 般很找难 完全 符合条到件的队列 。K cb r G等回顾 性 查20调0 sa  ̄ J0 克以上 生儿5新 例 8,新生 儿水病例 脱O ,随l选机对择照 l 3 1例3 4 ̄2根据 临,床病 和2 历~3 ) 龄4 内话电问身询发体育 0状{ 0 6 - ̄4况
,结 果 发现应 尽 完早全 母 乳喂奶 。 上 述 两种 类 型 巢 的 病式例 对 照 研 究 在 料 资的 计统 分 和 析
定的条件确某一个人群定作研究为的队 ,收列队列集中 个成 每
的员 关有资 料 信 息 / 和生 物 标 ,对本该 队 列 访 一 随 时段 间 ,或
将发生
在 该队列内的疾病的发病新全部例挑选出来 组,病成例 组, 并为 每
个病例取选一定量的数研对究象作对照组 ;对照为 组均产生 该队于内部 ,属于其对列的病应发病例尚时发生未
同 相疾 病 人 ,的 且并 年按 龄、 性别 、社 会 阶 层 因素 等进 行 匹配
(即危 险抽集样 ,)然后分别抽病出组例和对 组的相照 关 资此
结果的推论
方等面处的理是同的相。
料
及物生本标进行检 、整理 ,查后按最例病照研对 (究主要 是 2 按2对照 的择选方 法类分 .
配匹病例照对研)究的析方分 进行资料法的计分统析推和。 论
2
12 . .匹巢式配病例照对究研( t eN t ea -ot lMac d s C  ̄- er n d hCo
Su ) : 种类型的对照是这用匹 配的法进行选择方的 也就, d ty
2研 究类型
2 1按 列 确 定 的队时 间 分 类
是每. 当列 队发生内 个新病一的同例时在,队该 列内按部年龄 、 性别因素等选条件择同相相或近 、当的时尚未发相同生疾的病
一2
1前瞻性1巢式 病 例照研对 究 (sp tr e( m aN- e.. o e P i v mzct 9 C_ C nl tr ) d:这设种类计型 是在 究开始 研根据时一定 的 o t ou y S 条件选 择某一人作为群列 ,队后前然瞻地性访随一的定间确时 病定例 组 和对 照 ,其组 时在间上 的特 点为 现 在到从将来 。
或个几对象作个该病 为例对照的 ,每病个可例择选 lO l~
匹配对照+ (但 常最用K4 个的匹对照 配。) ~5 2 22 匹配不式病 巢对照研 究例 mac(e s d C s - .. U nt detN  ̄ a e
Ch nr tl ) d这种类型: 的 对照择选 时不 要任求条件 的何 ot oSy
u 继 教 医 0第第 1 l5 续 育 学23 卷期7
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匹配, 只 要求 在病例 发 病 时该 象 尚未对 患所 研 的究 疾病 可即。
暴露 的素因经 过l的年变迁能会有可改所 变(O 饮食如习惯 饮 、 水习 惯肠、相道关疾等病), 都有能与 当初基可线调查时有 所
不同。这些 改变能会影可响结 判论 断的准 确 性。
陈 坤 采 用该方进行法 肠癌结 直肠和癌险 危素因 研究。
上述 种两 法方在 设计 、 资 料 的统计 分析 方 法 等方 面不 完
全
相 ,从 目前能同集到收 的资来看料绝大多数巢,式例病对 照研
究 选择 是的 前 种一 型 类, 为因匹 巢配式 病 例对 照 究研 效 的率 明显高 于 后者, 且结 果 也 易 释 解 。
4 设计步 骤【 4 1
定 研 究目的 :研究 的 是目确 定
设 步计骤 的 出 发 点故, 必 .确 须明 本确次 研 究 目的的, 确 定本 次研 究 所 要 分 的析疾 病暴、
3 研特点
究巢式例病 照对究研将是 两种 同不的流 病 行分学析法方相 合组一的新种方 ,法此它因与统传方相法比有一些独特 之 。 处
3 1 统传的 病例 对照 研究 相E 巢 式: 病例对 研 究 照 病例比 对 与.
露
协变量等、。 42 确定研究队列. 巢:病式例照对究必须 研在 究研实施期初 确
定一 个合 适 的 群人 作 研 究为队 列。I0 j确 定 的 根据 不的同研 究 人歹
目的,可 选择以—般人 群( 例 某如个几个农村或乡 镇 或城社
区市,也)以可择职业人群 选(例 某个工厂或单位如的不同业职
研究照有 以下点优: )(巢病例式对研究照中 的例与病对 照 1 来
自于同队~ ,列此因降 了低效估应计的时选偏择且倚 比可性 好 ; )(巢式病例照对究中研的露资料暴 在是疾病诊前收 断 2
集的 如 果,研 结究果 显 示暴露 疾 病与存 关 在 ,联那 该 么 联关
的与群 人), 还可 以是 一 特些殊 人群 (如 患某疾种病 的 人
群 )例 。 另外 , 对 于 列 队的 本量 的样 小必大 有须 个科 一 的学 估 计,进 入队列人数的不 能过少 否,可则能 收集 不足 到的病 够例 ,也但不过宜多, 则否作工过量大。—般来讲,巢 病例式
对 照观察中队 列 人 数 应 的据根 发病率 、 例 病 的 组暴露 率、对 照
组
果推因断的间顺序时相符 ,而且合回偏 忆小倚或可 以避,因 免
果联系
的断推有更力 ;)(式病巢例对研究照统的计率和效
3验效率高于病检对照例究 研,而且 以可算疾计频率 病 例如累
(
积病发率) 。 32
.与 传统列研队究相比:巢 式 例病 照研对 比究统传I U 研
究
的暴露率 、许误允 、 0差和p ( I【类错误 与 Ⅱ错误 类)大的小 等
因来素定。确首先据病根例对研照的样本究估计公式计算出量
有以下优 点 : (比)队列研究 节 约大了量的力人、 物力财 和1
力 ; ( )式病巢 对照研究可例于罕用病见 研的 究,为因需 不 2
所需病例的例组 数,再 用例病组的估计例数以除发率病计 巢 算
病 例 式对照 研 究 需 所的研 究 列 队人的数
。要众多
研究对的 。象例 ,如I K 2 年在(9 31 9) 橡J i 172- 9 5
胶工 人中查仅发现调 9冽道癌食病例 根,据研究队列 胶橡人工 性别中年龄 和配原则选匹择 J ,结发现 果, 橡胶人工 的 照对 道食癌的险危度
轻度上升能可与业职露于粉暴和化尘溶学有
剂。 关
34 . 确观察期限 定根 :据研所究 病疾 的征和特究研实施程中过 的实际情况 , 定确一 重个 观的期察作为限对研究队进行列 随 的访 间 时。访随的 间时适应中 ,短则不过 能集收到够 足病的 例
, 过长 则浪 费 人 、 力物 力 和时间 。
4
收4集资 和料生标本 :物究队研确定后 ,列开始 收集即 队列 .
3
3 .选用条 :件以在下情 况特时别宜用适式巢例对病照 究研: ( 在瞻性 队前 研究列随访开的 始后 出又现了 种一的新病因 假 1) 设 , 这而 种素未因被量测或测量者贵昂时, 巢用病例式对研
照内
每成个的基员资料 础 (姓名年、龄性别、民、 、族 业职文、 化 度 、婚 姻史 、住程址等 )相, 关 暴资料 (露 研据 究 目 根 的 ),协量变料 资(吸 烟、酒 、饮性慢病史、并发 症史、流产 史 、
会社阶 层 饮食 习惯 生 活 嗜、好 家 、族 史 身 高 、体 重、 、
究很
有 ;利( )在究某研生些物 学 前体 (licg Fct 2 Boo i P e r ̄ -r)9某些与病疾联系的 时( 5 变 异与肿瘤 的关) ,系 巢 。 如P S3
式病对照研例不究仅对物生学体的检前测省省时钱且,可以确
知在病发疾生前些物这就质在存体于内。
腰 围臀围、I、 、心率 、血糖n等,)以队列内每个成员及的 or 物生标 本(血清 、白细 胞 、其或它组织标本 )并等妥保存善,
以备将 来检 查所 用。
34缺点
:巢式病例对 照研究也存一些在缺点 : ()式巢病 .
例1对研照究在计统率效 上队比列 研略究损失有尽管,省了人节
54访并随定确 例病组: 对研究队 列进 行随访 ,确以定预定在 . 观察 期内所限新有发生的研 究病的病例 疾,作为 研的究病例 组。 除集病收组成例员 发病况情外 ,还 应集生活质量收 疾病 、负担伤、残 况隋、死亡等 方的面息信 。 6对4照的定 :确确 对照定有 2. 种方法, 其一 是 研 从究队 中 列 发病未人的 间随机抽取 中;其二在是个每例病发病时 即立该
在、力 物力和 力财无疑也部,分减了少统信计息 量 (;巢式 ) 2 病例 照研对究索探病因 的能力赖依评 于价究 因素研水 平能 的力
,这可 能 会 导 致 测量 倚偏或遗 漏例 如。,陈 锎 查坤结 肠 癌 和 肠 癌直危 险 素 因发 时现 该, 研项 究随 访 时历1 ,年研 究 O
所7 C I M IL T '00_ 6l NN I A  ̄ v_I№3 I c (I. N Ol.
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队列中选择一定数量的到
该病例病发尚未发展时成病该例病 的 ,人按年和龄性等与别该病例行匹配,进而确从立对照 ( 该方 法称密度 样或危抽集险样抽)。 在大绝多数式病巢例对研照 中究选用都后者 匹作对照配。 采 用匹对照选择 时应配注 意下以点 几 (:)每个病匹 例 配对1照数的量定不, —般为 1 ; ()个间匹时配是研究本 ~ 5 2设 计 本质最 特征 的 ( )在某 一; 个间时上 点为 对照 的作成 员 3,在来的随访 后可能会发中展为例病, 这影响巢不式对照研 究设的计分析步和 骤 (;某)一队个列成 员可以 被选作择 为
几4种 疾 的病对 照。
方 等)及法其他 有的信用。
息
55访 随IG. 并发 症 人病 :访随队 列中 9 共年 生发GI 并发症6 6 1J
。歹『
56 匹用的配方选择法对照: 当每发生 一G个并 症病发 时, . I 人 即 该 从列队中 选择 5名同 年病人作为龄照。对 7 5 资料分析 :病例. 组对与照组 确定后 分别抽,出两组有资关 料进行分析。 ( 累)发积病率 =.0 0 (年龄) > 0 19 0 0; 2/ 1 岁7,O R I=0, 9C % .7 .=3 (透) 析,O 65 O9I 1O ~ ;3 R=8 ,I%9 .7 5 CI= 2~9 1; )(急应理处, OR . 51I . 7 I .2 . 83 =9 19 ,% C=I ~03
4. 0。
47
. 出病抽组例员和成对组照员 成有的关料资生物标和 本: 病组与对例照确组定后, 从收已集好的整研究队列个的料资中抽 出 上两述成组的相关资料员并从,本库中标抽出述 两组成上员
5
. 8论 :C G结以后,急处理应 、年> 0龄 B 7 A、岁透析会显著地 增 G 并发加概率 ;症G发症出现对并者患有具更负 面的影响 I I 。
忉
参 考献 文
[ Ro]r u s M ,b s A O,osM a F, e 1 1di e g ai h ta. e pHs ms x pe r i l
evu iyp n rfs t e 12 cetonn ie icr aes sH I 1i V ed ce:na Po - r
生的物标进本实验行室相指标的检测关 。由只于检测需例病
和组对照组员成生的标本物 ,以节约可 昂的贵物标本生检测的费 用 这正,是巢式病例对研究尤照 适用其于生物学前的相体研关 究 的 原
因之 一 。
set es u y i r l arz n[] p i c dt
u a Tn ai .AJI v n a DS2, 0;1 )(: 026 3
4 4 —. 51
48 .
资 料的析分 和讨论 :率对 ( 累积病发率发病、度、密标化 []
Es ao 2 c rb J,GG z os VM,lA r tno na em rsg A,e M 1ta .R e
—比等)、疾病
与暴露关的程度 联 R、O( RO9o可信的间估区 50 / 计、显著 性检验) 多、因素分 (O析 I e g因单分析素 多、因 素 回 分归析 非 、件条Igs c j.廿 因分析 等素进)行分析 (0 详细 见
)5 和讨论 。
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so1 a 『aon tf o nt ldy d a p 1t I 1 or e zna a e h ron:a tsee n t das ce-
c n l r t d[ o】t ou y J.rA hP ei to ce Me ,20 ;16 s c d ard Als d O 2 5
( :15 6 .2) 5—1 1
[坤 陈,剑蔡 刘,希 永, 等 .肠 癌和 直 肠癌 33] 结 研照 究[] J中. 流 华行 学病杂 志 ,0 ;22( ) 4: 4 0912 36—4 1
5
用应 例
R实ct eh MH I采 用式 病巢对例照研究方 ,法了一项作 冠动状搭脉桥 术 (A BC G后 胃肠并)发 的危险度症评价研究,
过程其和结如果 。 下
吴 传 ,深 东丰周,陈 ,等 汶 南林 .Al县eme 病 危 因险素的巢 式河z i r h 病例对照 分 析[ ] J. 中 心理国 卫生杂志 2, 0; 1() :4 —2 03 2785
.iK L Y&uSZ . e0 sop ge『ah caan cer a nd o ccu at i a『 po n
e p
sr or be :A et d c s — ot s u yJo. x o u e tub n s re eac n r tId ][ An
n ccou Yg. 2H Op O O4 4:() 3: 55 5 5 3 9—.
51 究 目 的:评冠状价脉动 桥术搭 AB (. C G研)后 胃 肠(I G) 并发
的症危度 。 险 5
确 定 2 队列 将 : 连续9 住 院 例病73 5病 例 为作 观 察 队 . 年4
例玲 ,周旭,徐胡亮天等 ., 糖型尿病高人危的早期预群测其评及 2
[】 J价 中.国公 共 生 ,2卫O 4;O 2 )(: 322 4. 0 93—9
Re c h tMH , Smi h , JoWdsoS E ,te . Pa rdi r ndot
M 1e t sca o
t ucmoseof gaS to1 esn t rn Itapl『 ic tanosn tae nsi i p t i ue rnd oi g n gco onr y aa re by ss yrgt su erg r t r pa af r: ya
列
, 中其 6 例出现G 发并症 ,用采式 巢例病照研对究 , 择选 6 I: 配1对照病例 对,3共0 对 照例 病 。5 个3
o p c i ep et d c s - ct o dt[ ] i r s e t, s en a e on rl u yd . Am Cdo v ls
5
3 确定 观察期 : 共察观 9。 . 年
Sr u g,2O O 4;1 8() :74 7 7 5 2- 49.
54
资 收料集: 对研 究队 列 内每的 个成 员 都记 录 —其 股况 情, .
【稿 E期收 :02— —21]l 0 255
包
括 并G症的发关 情有 (况I 发病程 、过 情病、疗过治程治疗、
【
文编 辑 贾 :云 鹰 ] 本
继医 教 第 0第1 7续 学 育 2 7 3卷 J
期
范文二:巢式PCR
巢式PCR
目录巢式PCR的定义: 巢式PCR反应: 巢式PCR的实验步骤: 巢式PCR的应用
巢式PCR的定义:
巢式PCR是一种变异的聚合酶链反应(PCR),使用两对(而非一对)PCR引物扩增完整的片段。第一对PCR引物扩增片段和普通PCR相似。第二对引物称为巢式引物(因为他们在第一次PCR扩增片段的内部)结合在第一次PCR产物内部,使得第二次PCR扩增片段短于第一次扩增。巢式PCR的好处在于,如果第一次扩增产生了错误片断,则第二次能在错误片段上进行引物配对并扩增的概率极低。因此,巢式PCR的扩增非常特异。 巢式PCR反应:
巢式PCR通过两轮PCR反应,使用两套引物扩增特异性的DNA片断。第二对引物的功能是特异性的扩增位于首轮PCR产物内的一段DNA片断。 第一轮扩增中,外引物用以产生扩增产物,此产物在内引物的存在下进行第二轮扩增。从而提高反应的特异性。
巢式PCR反应模式图:
巢式PCR的实验步骤:
第一步:目标的DNA模板蓝色的第一对引物结合。第一对引物也可能结合到其他具有相似结合位点的片段上并扩增多种产物。但只有一种产物是目的片断(图中未显示可能的多种产物)。
第二步:使用图中红色标记的第二套引物对第一轮PCR扩增的产物进行第二轮PCR扩增。
由于第二套引物位于第一轮PCR产物内部,而非目的片断包含两套引物结合位点的可能性极小,因此第二套引物不可能扩增非目的片断。这种巢式PCR扩增确保第二轮PCR产物几乎或者完全没有引物配对特异性不强造成的非特异性扩增的污染。
巢式PCR的应用
一般应用于动物方面。如:病毒,梅毒螺旋体,HIV,肿瘤基因等
在RACE(rapid-amplification of cDNA ends)中,也利用巢式PCR增加特异性
在Illumina公司平台的第二代高通量测序中,也应用类似巢式PCR的原理,进行目的片段的扩增。
如图,首先在目的片段通过TA克隆,引入一个片段,然后在特定的一个Flow Cell固定大量的特异探针,通过PCR反应的特异性,扩增目的片段,然后继续应用于下一步测序
巢式PCR,可以在10的六次方基因组背景下检测到一个拷贝的病毒基因,也不像二次PCR容易产生成片的产物,是效果最好的PCR,但也因此是最容易污染的PCR。
范文三:巢式PCR
巢式 PCR 目录
巢式 PCR 是一种变异的聚合酶链反应 (PCR), 使用两对 (而非一对) PCR 引物扩增完整的片段。第一对 PCR 引物扩增片段和普通 PCR 相似。第二对 引物称为巢式引物(因为他们在第一次 PCR 扩增片段的内部)结合在第一 次 PCR 产物内部,使得第二次 PCR 扩增片断短于第一次扩增。巢式 PCR 的 好处在于,如果第一次扩增产生了错误片断,则第二次能在错误片段上进 行引物配对并扩增的概率极低。因此,巢式 PCR 的扩增非常特异。
编辑本段
巢式 PCR 反应:
巢式 PCR 通过两轮 PCR 反应,使用两套引物扩增特异性的 DNA 片断。 第二对引物的功能是特异性的扩增位于首轮 PCR 产物内的一段 DNA 片断。 巢式 PCR 反应模式图:
编辑本段
巢式 PCR 的实验步骤:
第一步:目标的 DNA 模板蓝色的第一对引物结合。第一对引物也可能 结合到其他具有相似结合位点的片段上并扩增多种产物。但只有一种产物 是目的片断(图中未显示可能的多种产物)。
第二步:使用图中红色标记的第二套引物对第一轮 PCR 扩增的产物进 行第二轮 PCR 扩增。
由于第二套引物位于第一轮 PCR 产物内部,而非目的片断包含两套引 物结合位点的可能性极小,因此第二套引物不可能扩增非目的片断。这种
巢式 PCR 扩增确保第二轮 PCR 产物几乎或者完全没有引物配对特异性不强 造成的非特异性扩增的污染。
编辑本段
巢式 PCR 的应用
一般应用于动物方面。如:病毒,梅毒螺旋体, HIV ,肿瘤基因等 巢式 PCR ,可以在 10的六次方基因组背景下检测到一个拷贝的病毒基 因,也不像二次 PCR 容易产生成片的产物,是效果最好的 PCR ,但也因此是 最容易污染的 PCR 。
范文四:巢式PCR
巢式PCR
Definition of Nested PCR :巢式PCR的定义:
Nested PCR is a variation of the polymerase chain reaction (PCR), in that two pairs (instead of one pair) of PCR primers are used to amplify a fragment. The first pair of PCR primers amplify a fragment similar to a standard PCR. However, a second pair of primers called nested primers (as they lie / are nested within the first fragment) bind inside the first PCR product fragment to allow amplification
of a second PCR product which is shorter than the first one.
The advantage of nested PCR is that if the wrong PCR fragment was amplified, the probability is quite low that the region would be amplified a second time by the second set of primers. Thus, Nested PCR is a very specific PCR amplification. The Nested PCR Reaction
Nested PCR requires two sets of primers which are used to amplify a specific DNA fragment using two
separate runs of PCR.,. The second pair of primers function to amplify a smaller specific DNA fragment located within the first PCR product.
Nested PCR Reaction Diagram巢式聚合酶链反应图
Steps of the Nested PCR巢式PCR的步骤
Step One: The DNA target template is bound by the first set of primers shown in blue .. The primers may bind to alternative, similar primer binding sites which give multiple products however only one of these PCR products give the intended sequence (multiple products not shown).
Step Two: PCR products from the first PCR reaction are subjected to a second PCR run however with a second new set of primers shown in red
As these primers are NESTED within the first PCR product, they make it very unlikely that non-specifically amplified PCR product would contain binding sites for both sets of primers.. This nested PCR amplification ensures that the PCR product from the second PCR amplification has little or no contamination from non-specifically amplified PCR products from alternative primer target sequences.
巢式PCR是一种变异的聚合酶链反应(PCR),这两组(而非一对)PCR引物可用来扩增片段.第一对PCR引物扩增的片段与片段准相近. 第二对引称为巢式引物(因为他们巢嵌在第一片段内部). 与第一段PCR产物结合,来指导第二段PCR产物的合成,这段产物比第一段产物要短。巢式PCR的好处是,如果错误的PCR产物被扩增,那么由第二段引物指导的第二次扩增的产物错误的可能性将是非常低的.巢式聚合酶链反应 巢式PCR需要两套引物用于放大特定的DNA片,应用两次单独的PCR来进行。第二对引功能扩增较小的特定DNA片段,该片段位于一次PCR产物内部 因此,巢式PCR扩增是非常特异的.第一步:目标DNA片段与第一段引物(兰色)结合。引物可能回选择性的结合于模板,相似的引物结合位点会产生多重的产物,然而,只有一段产物是我们预期的。第二步:应用一次PCR产物区段,通过二次新的引物结合位点进行二次PCR(红色)。这些引物嵌套在一次PCR产物的内部,因此,非特异性片段的产生是不太可能的,一次PCR产物包含着二次PCR引物的结合位点。这种巢式PCR产物保证了通过二次PCR得到的产物很少有或者没有污染(杂带,也就是产物是符合我们需要的)也就是没有非特异性的条带
范文五:巢式PCR
巢式PCR
1.增效PCR,booster PCR,
当增少于扩扩扩扩1000拷的模板扩扩扩扩DNA扩扩扩扩扩会遇到两个:一是形成引物二聚体,一是非特异增,消耗了引物扩扩扩扩扩扩扩扩和,而特异增片段量降低。于情况,可置二扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩步
PCR,先用低度的引物行初扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩PCR,此由于引物扩扩扩扩扩少,形成引物二聚体的可能减少,但它并不影响靶序列的扩增,只是由于引物少量不高。扩扩扩扩扩扩扩15,20个循后充引物扩扩扩扩扩扩量,以初扩PCR扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩物模板行增,靶序列的
量将相增加。扩扩扩扩
2.巢式PCR
此也是行二扩扩扩扩扩扩扩步PCR,与上面不同的是,第二扩PCR需另行扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩置反体系,并用另外的PCR引物,此引物的位扩扩扩扩扩置位于初扩PCR引物的内,用初扩扩扩扩扩PCR扩扩扩扩扩扩物做模板,行第二步PCR,只有初扩扩扩扩扩扩PCR中特异的增片段才能被二扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩引物增。
除了达到增效PCR同的目的外,提高了扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩最物的特异性。扩扩扩扩扩扩扩扩
巢式PCR:利用两套PCR引物行两扩扩扩扩扩PCR扩扩扩扩扩增反成,在第一增中,外引物用以生增物,扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
此物在在内引物的存在下行第二增扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
,巢式RT- PCR,扩扩扩扩扩扩扩扩扩方法的特点是需要两引物,
一引物增稍片段,在一增范扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
内再一引物,增的物是以第一扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
引物的物模版扩扩扩扩扩
3.RT-PCR
RT-PCR是以mRNA扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩模板,逆作用合成cDNA。使微量的mRNA,pg水平,迅速增,达扩扩扩扩ng,ug水平,,大大提高mRNA的出灵敏度。用于基因表达与控的研究。扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
4.基因芯片
,又称DNA芯片,生物芯片,DNA探微列,,它扩扩扩扩扩扩扩集成了大量的密集排列的基因探,通与被基因扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩的碱基序列行互配,核酸序列的分子扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩。能在同一内分析大量的基因,生
物基因信息的大模。扩扩扩扩扩
基因芯片是指将大量探分子固定于支持物上,然后与的品针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针行交,通交信号的弱判断靶分子的数量强
1.基因芯片的制:针针
1原位合成(in situ Synthesis):
,光引原位合成针 针:
,通使用针针针4支分装有针针针A,T,G,C核苷的针针针
针在芯片上并行地合成出DNA探针
2合成后交(post-synthesis attachment)针:
,探制:针针针针
,点:化学射法针针针针针针针 ,针 点法
2.针针针品的制:
提取DNA或RNA,PCR或RT-PCR针针针针针针针针针增,入光染料
3.针交
芯片的交属于固液反相交即探分子固定于芯片表面针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针针, 与液相的靶分子行反针针针针
4.针针针针针针针针针针针交的和料分析
5.cDNA文:扩扩
提取出胞的全部扩扩扩扩扩扩扩mRNA,在体外反成扩扩扩cDNA,与适当的体常用噬菌体或粒体接后化受体菌,扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩个菌含有一段每
cDNA,并能繁殖增,包含着胞全部扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩mRNA信息的cDNA克隆集合称胞的扩扩扩扩扩扩扩cDNA文。扩扩
扩扩扩扩扩扩扩不包含内含子的基因文。
cDNA 文中的外源扩扩扩扩扩 DNA 片段是互扩 DNA ,complementary DNA , cDNA,。 cDNA 是由生物的某一特定器官或特定育期胞内的扩扩扩扩扩扩扩扩 mRNA 扩扩扩扩扩体外反后形成的双扩 cDNA 。
cDNA文是指胞全部扩扩扩扩扩扩扩mRNA逆成扩扩扩cDNA并被克隆的和,代表生物的某一特定器官或特扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
定育期胞内水平上的基因的群体,扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩
并不能包括生物的全部基因扩扩扩扩扩扩扩扩
cDNA 文的构建扩扩扩扩
cDNA 文的构建共分四扩扩:步
第一,胞扩扩扩 RNA 的提取和 mRNA 分离,
第二,第一扩 cDNA 合成,
第三,第二扩 cDNA 合成,
第四,双扩 cDNA 克隆粒或噬菌体体并入扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩扩宿主中繁殖。
,双针DNA合成后,利用核酸针S1切去回折针针针DNA,但会使
cDNA失去5‘端部分序列。在少用针针针针针
,RNaseH 部分水解交中的针针针针针RNA针,但留下一些小片段
RNA,作合成针针针cDNA第二的引物。需要加入针针针针针针针针针针DNA针接
针针接合成片段
,末端移在针针针针cDNA第一针3’端添加一寡聚寡聚核针针针针针针
苷酸尾巴,然后以配的寡聚物作引物合成第二针针针针针针针针针针针针针针6. DNA针序:
DNA 的序列分析的两基本方法:针针针针针针
,化学法Maxam-Gilbert
,针 法Sanger,双脱氧止法针针针
针针针针针针针针 在全自序仍然沿用Sanger 氏法,但是针针针针针在上作了改针针针针针针针
1.双脱氧止法:针针针针
双脱氧核苷酸(ddNTP) 的脱氧核糖的 3‘ 位置的 -OH 缺失。
当它与其他正常核苷酸混合在同一个增反体系中针针针针针针针针在 DNA 多聚的作用下,然它也能象正常针针针针针针针针针针针针针针针核苷酸一参与针针针 DNA 合成,以其 5' 位置的磷酸基,与上位脱氧核苷酸的 3' 位置的 -OH 针 合,但是,由于它自身3' 位置 -OH 的缺失,至使下位核苷酸的 5' 磷酸基无法与之针针 合
针程:
,针针4针针针针针反体系:
,都含有正常的4针dNTP,其中一用同位针针针针
素针针针,
,针针DNA模板,即待针DNA,
,引物和DNA聚合针I
,每针针针针针针针分各加入一ddNTP
,如果是 dNTP 针 入其中,DNA 互将针针针针针针针针延伸
下去,
,如果是 ddNTP 针 入其中,DNA 互的合成到针针针针针针针
此止。由于双脱氧核苷酸的入针针针针针针针针针针针针针针
是随机的,故各个新生 DNA 片段的度互不相同针针针针针针通聚针针针针针针针针针针针针针针针针针针丙胺凝胶泳,能分辨出小至一个碱基度针针针针 差的DNA 片段,,将混合物中不同度针针针针针针针 DNA 片段分离,再通针针针针针针针针针针针针针针针放射自影,根据片段尾部的双脱氧核苷酸出针针针 DNA 的碱基排列序针针
2.DNA 自动动序,
,基于 Sanger 动动止法的原理~只不动 用四动不同的动光染料双脱氧
分动动动 ddATP、ddTTP、ddCTP、ddGTP 。
,动四动动光染料在激光激动下动出不同波动的动光~因而每一动动光代表一
动基。碱
,延伸中的 DNA 互动动分动动止于不同动光动动的
ddATP、ddTTP、ddCTP、ddGTP